Lo importante es el tamaño del sensor y de los píxeles... El sensor de 50Mpx tiene píxeles de 0,6µm, con lo cual recibirá menos de la mitad de luz que el de 12Mpx con pixeles de 1.4µm... a grosso modo y sin entrar en demasiados detalles.
Efectivamente, como dice Trokko, para que los 50mpx funcionen al máximo tienen que ser en condiciones de mucha luminosidad, si no, efectivamente el de 12 es mejor