Welche Art von Lesezeichen brauchst du denn?
1. Eines um da weiter zu machen wo du letztens aufgehört hast?
2. Eines, um einzelne Seiten zu markieren?
Wenn 1., dann ist es so, dass in Notes gespeicherte PDFs sich beim nächsten öffnen genau dort wiederöffnen, wo du das letzte Mal aufgrhört hast zu lesen.
Wenn du 2. meinst, dann geh oben, wo der Name der geöffneten PDF steht an der Ecke auf die 3 Punkte >> Seitensortierer.
Es öffnet sich eine Übersicht aller Seiten. An jeder einzelnen Seite ist oben ein graues Lesezeichen.
Such die Seiten, die du markieren willst und drück auf das besagte Lesezeichen. Es wird sich rot färben und du kannst beim nächsten Mal über diese Ansicht deine markierten Lesezeichen wiederfinden.